1954年5月1日成立于东京，由成濑昌彦、天野创治郎、土方弘、森塚敏、中台正（后改名中台祥浩）、初井言荣、东惠美子、出冈比佐乃（后改名山冈久乃）、高桥真子（后改名氏家慎子）、关弘子10名俳优座的候补团员脱离俳优座后创建，当时被称作俳优座剧团的卫星剧团之一。青年座第一个公演剧目是椎名麟三创作、木村铃吉导演的《第三证言》。

20世纪50～60年代，日本各剧团争相排演外国剧目，青年座反对这种趋势，主张演出日本的创作剧，并上演了《第三证言》《残响》《白蚁之巢》《象与簪》《三个盗贼》《昭和之子》《朋友》等作品。这一时期，青年座的文艺顾问由内村直也、三岛由纪夫担任。1969年，青年座剧场在东京都涩谷区代代木八幡落成，拥有专属剧场后其创作活动更加活跃。剧作家们创作了大量原创作品，包括椎名麟三创作的《饲蝎女》，八木柊一郎创作的《空巢》，矢代静一创作的《宫城野》，宫本研创作的《卖身女》，水上勉创作的《文那，从树上下来吧》等。这一时期青年座开始尝试改编外国作品，包括《秃头歌女》《三分钱歌剧》《当风吹起的时候》《卡门》等，其中《秃头歌女》《三分钱歌剧》等剧目曾多次获奖。1975年成立演员培训机构研究所，研究所的演员培训课程分为第一年的本科课程与第二年的实习科课程，培养的知名演员有：山路和弘、竹中直人、段田安则、上杉祥三、山崎清介、近藤芳正、绪形直人、铃木浩介、松浦佐知子、津田真澄、那须佐代子等；知名剧作家、导演有：宫田庆子、钟下辰男等。1981年水上勉原作《文那，从树上下来吧》访问中国演出后，青年座开始积极推动海外公演。《写乐考》《盟三五大切》等作品相继赴海外演出。进入21世纪，青年座顺应时代的变化开始引入制作人模式，深入市场调研，了解观众需求，同时创办剧团专属杂志并积极开展与日本新剧团协议会等团体的合作，利用社会力量发展剧团。这一时期新一代剧作家牧野望、钟下辰男、坂手洋二、永井爱、松田正隆、铃木聪等人的作品受到人们关注。

2007年青年座在中国江苏南通演出剧照

青年座多年来坚持“上演创作剧”的理念，创作对当代日本的社会问题加以尖锐批判的剧目和以当代观点阐释的近代古典经典剧目，不断为日本戏剧界注入更加活跃、富有生气的活力。代表剧目有《饲蝎女》、《8段》(田中千禾夫作)、《象与簪》（矢代静一作）、《卖身女》等。剧团分别在1968年、1971年、1997年3次获得纪伊国屋戏剧奖团体大奖。通过研究所以及不断推出的原创剧目，剧团为日本戏剧界，电影电视等领域培养出众多优秀演员、编剧、导演等人才。