1925年7月，广州国民政府中央执行委员会议决设立军事委员会，以统率海陆军、航空队及军事各机关，并议定该会组织法，同月5日公布。共11条。主要内容包括：①军事委员会受中国国民党中央的指导和监督，管理统率国民政府所辖境内海陆军、航空队及一切关于军事各机关。②军事委员会由委员若干人组成，委员无定额，从委员中推举一人为主席，并由国民政府特任一人为军事部长。③军事委员会设政治训练部、参谋团、海军局、航空局、军需局、秘书厅、兵工厂等机关，由各委员分别担负直接监督的责任。④军事委员会在通常情况下，采用民主制，决议要由2/3以上委员通过才有效。但是，赋予主席以紧急处置权；允许主席与委员一人可作出决定。⑤关于国防计划，军事动员，军制改革，高级军官、军佐任免，陆海军移防，预算、决算，以及高等军事裁判等事项，均由主席及军事部长署名执行。

　　1927年7月12日，南京国民政府将《中华民国国民政府军事委员会组织法》修订为《军事委员会组织大纲》。共13条。主要内容包括：①军事委员会负责全国陆海军编制、统御、教育、经理、卫生及充实国防之责，在战时得设立国民革命军总司令。②委员由中央执行委员会遴选，由国民政府特任，并由委员会互选5～7人为常务委员，再互选1人为主席。③会内设总务、参谋、军务、军事教育4厅，及海军、航空、经理、政治训练4处。该法施行后，于同年11月25日进行修订，将主席制改为主席团制，并由主席团推定常务委员，会内所设机关也略有变更。